文化部指出,依據代辦協議書明定代辦工程費「以核定預算為限」,同時規定「於委託代辦應行事項範圍內,應以善良管理人之注意義務,履行協議書內容。」台北市政府於2018年提出追加15億元的要求,預算暴增1/3至60億元,行政院雖勉於同意所求,但於核定函時也再次強調,北流工程延宕11年之久,北市府應確實督導監控各項進度,並應善盡主管機關責任,檢討並審慎釐清相關責任。
文化部表示,在行政院核定增列15億元預算前,台北市政府即已發生追加預算未經行政院核定即發包施作前例,雖2.6億元後由北市府自行支應。但北市府卻又於風光開幕後,提出工程爭議款1.9億元,要求文化部支應。文化部表示,北市府於履約過程中,不僅未依協議書規定妥適控管工程費用上限,以致產生爭議款項,且北市府自始至終並沒有善盡管理人責任。
文化部強調,新任台北市長蔣萬安上任後,文化局長蔡詩萍先後兩次拜訪前任及現任部長李永得、史哲,文化部也釋出善意,請北市府補充相關爭議資訊後,由文化部委請律師提出法律意見書。但依律師法律意見書目前所顯示相關資訊,並無法排除台北市政府責任,整體計畫經費仍應依協議書規定,於核定60億元預算內執行。